Turtinga komplekso architektūrinė istorija prasidėjo užbaigus pirmąjį muziejaus pastatą, kurį 1939 m. Pastatė Philipas L. Goodwinas ir Edwardas Durellas Stone'as, ir iškart paaiškėjo, kad nepakanka vietos. Philipas Johnsonas pastatė du papildomus pastatus MOMA - 1951 m. (Dabar nugriautas) ir 1964 m. Cesaras Pelli į kompleksą įtraukė parodų erdves, taip pat 52 aukštų „Muziejaus bokšto“gyvenamąjį kompleksą.
Taniguchi, dirbęs prie rekonstrukcijos projekto kartu su „Kon Pedersen Fox“biuru, bandė išsaugoti visus ankstesnio restruktūrizavimo pėdsakus, pabrėždamas juose netikėtus kampus.
Nepaisant to, kad XX amžius baigėsi ir ilgą laiką moderniausias menas buvo eksponuojamas Guggenheimo muziejuje, architektas neskyrė pastato intensyvaus dėmesio ateičiai. Priešingai, pabrėžtas sienų tiesiškumas ir lygūs paviršiai perteikia šios istorinės patirties išsamumą.
Prieš naująjį vestibiulį su pilko stiklo ir juodo granito fasadu prieš tai - skirtingų laikų pastatų ansamblis. Viduje, eidamas išilgai baltų kolonų eilės, lankytojas patenka į didžiulį atriumą, aplink kurį sutelktos parodų galerijos visuose šešiuose aukštuose. Šviesos tiltai prie tolimiausios vestibiulio sienos sujungia skirtingo lygio sales.
Vėlesni kūriniai yra viršutinėje dalyje, ankstyvoje, besąlygiškoje 20-ojo amžiaus meno klasikoje.
Kai lankytojas žvelgia žemyn iš viršutinės salių pakopos, jis mato tarp šviesos ir tarsi ištirpdo oro architektūroje reikšmingiausius konkretaus laikotarpio darbus. Žvelgiant pro stiklinę vieno iš Taniguchi priestato fasadų sieną, Rodino „Balzac“ir itališki sportiniai automobiliai vienu metu matomi skirtingų lygių galerijose.
Ypatingą vietą muziejaus ansamblyje užima sodas su raudančiais beržais ir marmuriniais tiltais, įsikūręs už stiklinės vestibiulio sienos. Jis įrengtas žemose terasose, kurios suteikia erdvų pojūtį. Kartu su nauju šešių aukštų pastatu į sodą taip pat atsiveria seni pastatai, kuriuose dabar įsikūręs švietimo centras, kino biblioteka ir nuotraukų archyvas.
