Pastatas yra uolos, ant kurios yra „Akropolis“, papėdėje. Dėl svetainės ypatumų ji orientuota išilgai rytų - vakarų ašies, tačiau užimanti visą viršutinį, trečią aukštą, Parthenono galerija yra smarkiai išdėstyta pagrindinio pastato tūrio atžvilgiu ir yra nukreipta į šiaurę. Tai ne tik leido iš dalies išspręsti perkaitimo karštame klimate problemą, bet ir vizualiai sujungė salę su skulptūromis, kurios kažkada puošė didžiosios šventyklos fasadus, su pačiu Partenonu, esančiu mažiau nei 300 metrų nuo muziejaus. Dinaminis šio sprendimo poveikis užpildo pastatą energija; čia galima įžvelgti tam tikrą simbolinę prasmę: atrodo, kad jis krypsta į Akropolį, į praeitį, o tai atitinka Graikijos vyriausybės naujame pastate pateiktą politinę žinią: pasukime laikrodį atgal ir sugrąžinkime paminklą į savo pastatą pirminė valstybė (arba bent jau suveskite visas jos dalis, dabar saugomas Londone, Paryžiuje, Palerme, Romoje).
Tokia retorika galėjo turėti įtakos architektūriniam projektui: net ir laimėjus „Chumi“versiją 2001 m. Konkurse, Graikijoje buvo daugybė neoklasikinio muziejaus pastato rėmėjų. Tačiau labai diskretiškas stiklo, betono ir marmuro tūris suteikia daug diskretiškesnio fono skulptūrų kolekcijai nuo archajiško laikotarpio iki romėnų laikų nei kažkokia „istorizuojanti“konstrukcija.
Atsižvelgiant į tai, kad po pastatu buvo rasti senovės laikų miesto kvartalo palaikai, nuspręsta jį pakelti virš žemės ant 100 betoninių atramų su „vyriais“, kurios turėtų sušvelninti vibraciją galimo žemės drebėjimo atveju; iš pirmo žvilgsnio jie yra išdėstyti atsitiktinai, tačiau iš tikrųjų - kad nepakenktų archeologiniams radiniams. Senovinių namų pamatai matomi per angas ir įstiklintas zonas muziejaus pirmo aukšto aukšte, kur yra laikinų parodų prieangis ir salės. Iš ten lankytojas pakyla į antrą aukštą, kur eksponuojami visi eksponatai, išskyrus Parthenono skulptūras, taip pat yra atvira terasa su kavine. Trečias aukštas su „Parthenon galerija“yra stačiakampio formos įstiklinta erdvė, kurios centre yra betono tūris, atkartojantis šventyklos žiedo dydį. Garsusis frizas su „Panathenaic“procesija buvo atkurtas iš originalių dalių ir aktorių.
Rimtoji „meno šventyklos“atmosfera muziejuje išliks nepaisant laukiamo didžiulio lankytojų skaičiaus: triukšmą sugers daugybė apskritų skylių, padarytų betoninėse sienose. Be to, kad nėra jokio dekoro, ženklų ir etikečių skaičius sumažintas iki reikiamo minimumo: niekas neturėtų atitraukti dėmesio nuo eksponatų. Gerai apgalvotas maršrutas palengvins kolekcijos apžiūrą: nuo archeologinių kasinėjimų po pastatu iki archajiškos skulptūros antrame aukšte, tada iki Parthenono galerijos trečiame, o paskui iki helenistinių ir Romos laikotarpiai.