Projektą vykdė bendrovė „NOC“(„Hellmuth, Obata & Kesselbaum“), labai sėkmingo Nacionalinio aeronautikos muziejaus pastato Vašingtone autoriai. Linkolno muziejaus įkūrėjų tikslas buvo sukurti kompleksą, kuris ne tik įamžintų didžiosios politinės asmenybės atminimą, bet ir pasakotų apie jo, kaip gyvo žmogaus, gyvenimą, o ne Amerikos demokratijos simbolis. Tam, kad pritrauktų kuo daugiau jaunų žmonių, ekspozicijos dažniausiai yra interaktyvios, plačiai naudojamos istorinių scenų rekonstrukcijos „vaško muziejaus“dvasia.
Architektūros projektas buvo „pritaikytas“tokiam turiniui, tuo tarpu neabejotinai nukentėjo jo originalumas. Tuo pačiu metu, žvelgiant į jo klasifikuotas formas, negalima nepastebėti panašumų su prekybos ar pramogų įstaigomis, stilizuotais „antikvariniais“. Pagrindinis motyvas buvo graikų tholos šventykla: ji kompozicijoje buvo naudojama tris kartus: kaip pagrindinis įėjimas, kaip suporuotas tūris, sukuriantis įėjimo kompozicijos išvaizdą, o pastato centre dedama kita rotonda: dalis jame rekonstruotas Baltųjų rūmų interjeras.
Likęs kalkakmeniais dengtas muziejaus pastatas yra nuobodus stačiakampio formos tūris, praskiestas ne vietoje pseudo-klasikiniame pastate, modernistiniais juostų langais ir sustiprintomis Wrighto „prerijų namų“karnizais.
