Klientai buvo pora verslininkų ir kolekcininkų - Viktoras ir Danguole Butkus. Jų kolekciją sudaro 226 Lietuvos dailininkų darbai nuo 1950-ųjų iki šių dienų - apie 5000 tapybos, grafikos, skulptūros, fotografijos ir videomeno kūrinių. MO muziejų suprojektavo Danielio Libeskindo dirbtuvės, bendradarbiaudamos su Vilniaus biurais „Do“architektais ir „Baltic Engineers“.
Pastatas yra ant senamiesčio ribos, išnykusių tvirtovės sienų linijoje, kur netaisyklingas viduramžių išdėstymas įsilieja į XVIII amžiaus kvartalų tinklelį. Muziejaus vietoje anksčiau veikė modernistinis kinas „Lietuva“(1965 m.), Kurį įsigijo MO griovimo projekto iniciatoriai.
Istorinių pastatų aplinka apibrėžė muziejaus išvaizdą: tai blokas ryškiai baltais tinkuotais fasadais. Ją perpjauna atviri laiptai, vedantys į terasą, kuriuos šiltuoju mėnesiu galima naudoti viešoms diskusijoms ar pasirodymams. Įstiklinta siena sujungia ją su parodų salėmis. Kita svarbi viešoji erdvė yra skulptūrų sodas gatvės lygyje.
Įėjimas į pastatą yra iš šiaurės, stiklinėje sienoje, už kurios yra dviejų aukštų fojė. Įstiklintos angos interjere leidžia pažvelgti į viršutinį ir apatinį aukštus, taip pat į sandėliuką; juodi spiraliniai laiptai jungia apatinį vestibiulio lygį ir pagrindinę parodų salę. Bendras muziejaus plotas - 3100 m2, nuolatinė ir laikina ekspozicija - 1300 m2. MO taip pat turi kavinę, knygyną, švietimo centrą, auditoriją, minėtą sandėliuką ir administracinius biurus.