Pastatas įsikurs Oresundo sąsiaurio pakrantėje, apsuptas dirbtinių rezervuarų. Kalbant apie tai, jis primena sūkurinę vonią, kuri yra ne tik formalus prietaisas, bet ir neša funkcinę apkrovą - kiekvienoje „rankoje“bus atskira parodų zona, skirta vienam iš vandenynų. Jei ateityje akvariumas nusprendžia plėstis, bet kurį iš šių kūnų galima pailginti su minimaliomis sąnaudomis; statybų metu muziejus galės veikti kaip įprasta.
Pastato centre yra „Apvalus kambarys“, iš kurio atsiveria visi pagrindiniai kambariai, įskaitant vestibiulį, kurio grindys yra permatomas baseino dugnas.